Důležitá železniční křižovatka ve Veselí nad Lužnicí, odkud jezdí vlaky na Budějovice, Prahu, Jindřichův Hradec, Brno a do Rakouska, zcela mění podobu. Nádraží již chybí staré koleje a také některé budovy musely uvolnit místo stavbě tranzitního železničního koridoru.  Výluka všech vlaků začne ve středu 23. dubna v 7:30 a potrvá do úterý 29. dubna do 19:25 hodin. Po celou tuto dobu budou přepravu zajišťovat desítky autobusů, které pojedou podle výlukového jízdního řádu.

Souběžně se ve stejném termínu uskuteční denní výluky ještě v úseku Soběslav – Veselí nad Lužnicí v době od 8:00 do 16:55 hodin, v pondělí 28. dubna od 6:15 do 18:35 hodin a v úterý 29. dubna od 6:15 do 14:35 hodin ještě v úseku Veselí nad Lužnicí – Jindřichův Hradec. Během výluk nahradí všechny vlaky autobusy, které pojedou podle výlukového jízdního řádu následujícím způsobem:

Za rychlíky Praha – České Budějovice pojede náhradní autobusová doprava v úseku Tábor – České Budějovice. Za většinu vlaků pojedou vždy dva spoje náhradní dopravy: jeden pojede bez zastavení ve stanicích Soběslav a Veselí nad Lužnicí tak, aby byly zajištěné přípoje ve stanici České Budějovice. Druhý spoj pojede přes stanice Soběslav a Veselí nad Lužnicí a do stanice České Budějovice přijede cca 20 minut později, naopak zpět pojede ze stanice České Budějovice o 17 minut dříve.

Za rychlíky Brno – České Budějovice – Plzeň pojede náhradní autobusová doprava v úseku Doňov (ve dnech 28. a 29. dubna souběžné výluky již z Jindřichova Hradce) – České Budějovice. Za většinu vlaků pojedou vždy dva spoje náhradní autobusové dopravy: jeden ve směru Doňov bez zastavení ve stanici Veselí nad Lužnicí, který pojede v pravidelné časové poloze vlaku i se zajištěním přípojů ve stanici České Budějovice (vyjma rychlíků směr Plzeň). Druhý spoj pojede přes stanici Veselí nad Lužnicí a pojede ze stanice České Budějovice o 10 minut dříve. Ve směru České Budějovice mimořádně zajede do stanice Hluboká nad Vltavou, kde je zajištěn přestup na rychlíky ve směru Plzeň, který nebude ve stanici České Budějovice.

Za osobní a spěšné vlaky pojede náhradní autobusová doprava v úseku Tábor – České Budějovice. Za vybrané vlaky pojedou vždy dva spoje náhradní dopravy, kde jeden pojede jen s obsluhou vybraných zastávek a druhý s obsluhou všech zastávek.

Umístění zastávek náhradní autobusové dopravy
• České Budějovice – pro nástup před nádražní budovou; pro výstup ul. Žižkova před Mercury
• České Budějovice severní zastávka – na silnici před viaduktem u zastávky;
• Hrdějovice – na návsi u autobusové zastávky;
• Hosín – na návsi na zastávce MHD
• Hluboká nad Vltavou-Zámostí – před nádražní budovou
• Chotýčany – na odbočce k nádraží, zastávka ČSAD 400 m
• Ševětín – před nádražní budovou
• Neplachov – na autobusové zastávce na silnici E 55, 100 m;
• Dynín – před nádražní budovou
• Horusice – na odbočce k budově ČD na silnici směr Sviny, cca 150 m;
• Veselí nad Lužnicí zastávka – u zastávky ČD;
• Veselí nad Lužnicí – před nádražní budovou
• Doňov – před nádražní budovou
• Řípec-Dráchov – parkoviště u Sloupu na E 55;
• Soběslav – před nádražní budovou
• Roudná – u hotelu Lužnice, u přejezdu
• Doubí u Tábora – na silnici I. tř. u odbočky k zastávce ČD;
• Planá nad Lužnicí – před nádražní budovou
• Sezimovo Ústí – na zastávce MHD u Vodních staveb ;
• Tábor – Čápův dvůr na zastávce MHD "Sídliště nad Lužnicí" naproti Baumax
• Tábor – před nádražní budovou